ニンジャバットマン対ヤクザリーグ

前作『ニンジャバットマン』で戦国時代の歴史改変を食い止め、現在のゴッサム・シティに戻ったバットマン・ファミリー。しかし、次の日、彼らは驚愕の事態を目にする。日本列島が消失し、ゴッサム・シティ上空に「ヒノモト」と呼ばれる巨大な島が現れたのだ。やがて、上空から無数のヤクザが降下し、ゴッサム・シティの人々に襲いかかる。さらには、彼らを守るべき…。